MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus thuringiensis HD-771 plasmid p08

Total Repeats: 251

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018490	CAT	2	6	53	58	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_018490	T	6	6	70	75	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018490	ATT	2	6	101	106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018490	CAA	2	6	121	126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_018490	CACT	2	8	142	149	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_018490	ATC	2	6	173	178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_018490	TTCTT	2	10	231	240	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_018490	A	7	7	260	266	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018490	CCT	2	6	268	273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_018490	A	6	6	356	361	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018490	TA	3	6	371	376	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018490	TAT	2	6	383	388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018490	TA	3	6	393	398	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018490	ATA	2	6	403	408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018490	CAC	2	6	424	429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_018490	T	6	6	432	437	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018490	A	7	7	492	498	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018490	A	7	7	504	510	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018490	A	7	7	536	542	100 %	0 %	0 %	0 %	402574995
20	NC_018490	CCA	2	6	545	550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	402574995
21	NC_018490	T	9	9	551	559	0 %	100 %	0 %	0 %	402574995
22	NC_018490	TGC	2	6	566	571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	402574995
23	NC_018490	T	7	7	577	583	0 %	100 %	0 %	0 %	402574995
24	NC_018490	TTTC	2	8	595	602	0 %	75 %	0 %	25 %	402574995
25	NC_018490	CTAA	2	8	609	616	50 %	25 %	0 %	25 %	402574995
26	NC_018490	ATC	2	6	648	653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402574995
27	NC_018490	TGATT	2	10	660	669	20 %	60 %	20 %	0 %	402574995
28	NC_018490	ATTTA	2	10	674	683	40 %	60 %	0 %	0 %	402574995
29	NC_018490	TAT	2	6	703	708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402574995
30	NC_018490	TTA	2	6	747	752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402574995
31	NC_018490	C	7	7	754	760	0 %	0 %	0 %	100 %	402574995
32	NC_018490	AT	3	6	772	777	50 %	50 %	0 %	0 %	402574995
33	NC_018490	CAA	2	6	820	825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402574995
34	NC_018490	TCCT	2	8	847	854	0 %	50 %	0 %	50 %	402574995
35	NC_018490	ATA	2	6	871	876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402574995
36	NC_018490	AAG	2	6	936	941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402574995
37	NC_018490	TC	3	6	956	961	0 %	50 %	0 %	50 %	402574995
38	NC_018490	ATA	2	6	971	976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402574995
39	NC_018490	T	6	6	977	982	0 %	100 %	0 %	0 %	402574995
40	NC_018490	TGC	2	6	1013	1018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	402574995
41	NC_018490	TTGTT	2	10	1019	1028	0 %	80 %	20 %	0 %	402574995
42	NC_018490	AT	3	6	1034	1039	50 %	50 %	0 %	0 %	402574995
43	NC_018490	AAC	2	6	1040	1045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402574995
44	NC_018490	TA	3	6	1108	1113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018490	T	6	6	1173	1178	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018490	A	6	6	1179	1184	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018490	T	6	6	1197	1202	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018490	A	6	6	1327	1332	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018490	A	6	6	1346	1351	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018490	TAAA	2	8	1358	1365	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018490	CTT	2	6	1386	1391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_018490	TTTCCA	2	12	1398	1409	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_018490	AT	3	6	1463	1468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018490	CTT	2	6	1478	1483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_018490	TCT	2	6	1525	1530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_018490	TA	3	6	1553	1558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018490	GC	3	6	1625	1630	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_018490	T	6	6	1713	1718	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018490	AT	3	6	1734	1739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018490	TCT	2	6	1747	1752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_018490	CTG	2	6	1807	1812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_018490	CATTT	2	10	1814	1823	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_018490	T	7	7	1827	1833	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018490	ATTA	2	8	1932	1939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018490	AATC	2	8	1943	1950	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_018490	TAT	2	6	1956	1961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018490	A	6	6	2062	2067	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018490	T	7	7	2135	2141	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018490	T	6	6	2181	2186	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018490	AGA	2	6	2189	2194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018490	A	7	7	2222	2228	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018490	GTG	2	6	2229	2234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018490	T	7	7	2380	2386	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018490	A	6	6	2393	2398	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018490	T	8	8	2409	2416	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018490	A	7	7	2471	2477	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018490	TATT	2	8	2543	2550	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018490	TGG	2	6	2554	2559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018490	T	7	7	2574	2580	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018490	A	6	6	2640	2645	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018490	TAAAA	2	10	2658	2667	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018490	T	7	7	2684	2690	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018490	ATG	2	6	2785	2790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018490	GTA	2	6	2848	2853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018490	TAAAA	2	10	2858	2867	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018490	A	8	8	2864	2871	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018490	T	7	7	2914	2920	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018490	AAT	2	6	2933	2938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018490	GCT	2	6	2946	2951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_018490	TCA	2	6	2964	2969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_018490	CTT	2	6	2974	2979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_018490	ACA	2	6	3008	3013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_018490	A	7	7	3066	3072	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018490	TA	3	6	3092	3097	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018490	A	7	7	3203	3209	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018490	AAT	2	6	3229	3234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018490	TA	3	6	3253	3258	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018490	AT	3	6	3273	3278	50 %	50 %	0 %	0 %	402574996
99	NC_018490	TCA	2	6	3287	3292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402574996
100	NC_018490	CAAA	2	8	3384	3391	75 %	0 %	0 %	25 %	402574996
101	NC_018490	TTC	2	6	3394	3399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402574996
102	NC_018490	AAT	2	6	3430	3435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402574996
103	NC_018490	TCA	4	12	3437	3448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402574996
104	NC_018490	ATTA	2	8	3469	3476	50 %	50 %	0 %	0 %	402574996
105	NC_018490	TCT	2	6	3506	3511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402574996
106	NC_018490	ATA	2	6	3515	3520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402574996
107	NC_018490	T	8	8	3540	3547	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018490	T	6	6	3564	3569	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018490	TAT	2	6	3582	3587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018490	TACAA	2	10	3602	3611	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_018490	ATA	2	6	3621	3626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018490	A	6	6	3636	3641	100 %	0 %	0 %	0 %	402574997
113	NC_018490	CAAT	2	8	3666	3673	50 %	25 %	0 %	25 %	402574997
114	NC_018490	A	6	6	3677	3682	100 %	0 %	0 %	0 %	402574997
115	NC_018490	AGA	2	6	3698	3703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402574997
116	NC_018490	CTA	2	6	3715	3720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402574997
117	NC_018490	CAA	2	6	3727	3732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402574997
118	NC_018490	TAAA	3	12	3757	3768	75 %	25 %	0 %	0 %	402574997
119	NC_018490	A	8	8	3766	3773	100 %	0 %	0 %	0 %	402574997
120	NC_018490	ATA	2	6	3782	3787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018490	CTAA	2	8	3800	3807	50 %	25 %	0 %	25 %	402574998
122	NC_018490	TA	3	6	3818	3823	50 %	50 %	0 %	0 %	402574998
123	NC_018490	A	6	6	3882	3887	100 %	0 %	0 %	0 %	402574998
124	NC_018490	AAAT	2	8	4024	4031	75 %	25 %	0 %	0 %	402574998
125	NC_018490	CAA	2	6	4039	4044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402574998
126	NC_018490	TTC	2	6	4068	4073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402574998
127	NC_018490	TTTCAC	2	12	4088	4099	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	402574998
128	NC_018490	CTT	2	6	4107	4112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402574998
129	NC_018490	ATC	3	9	4127	4135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402574998
130	NC_018490	AAATC	2	10	4137	4146	60 %	20 %	0 %	20 %	402574998
131	NC_018490	TCA	2	6	4161	4166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402574998
132	NC_018490	CTT	3	9	4183	4191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402574998
133	NC_018490	ATTT	2	8	4199	4206	25 %	75 %	0 %	0 %	402574998
134	NC_018490	CAA	2	6	4231	4236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402574998
135	NC_018490	TTC	2	6	4239	4244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402574998
136	NC_018490	TAA	2	6	4298	4303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402574998
137	NC_018490	CT	3	6	4325	4330	0 %	50 %	0 %	50 %	402574998
138	NC_018490	AATCA	2	10	4346	4355	60 %	20 %	0 %	20 %	402574998
139	NC_018490	ACCA	2	8	4393	4400	50 %	0 %	0 %	50 %	402574998
140	NC_018490	CAAT	2	8	4434	4441	50 %	25 %	0 %	25 %	402574998
141	NC_018490	TTA	2	6	4530	4535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402574998
142	NC_018490	AT	3	6	4554	4559	50 %	50 %	0 %	0 %	402574998
143	NC_018490	GAC	2	6	4573	4578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	402574998
144	NC_018490	AT	3	6	4648	4653	50 %	50 %	0 %	0 %	402574998
145	NC_018490	TCT	2	6	4665	4670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402574998
146	NC_018490	AC	3	6	4696	4701	50 %	0 %	0 %	50 %	402574998
147	NC_018490	TGT	2	6	4709	4714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402574998
148	NC_018490	CT	3	6	4723	4728	0 %	50 %	0 %	50 %	402574998
149	NC_018490	A	6	6	4731	4736	100 %	0 %	0 %	0 %	402574998
150	NC_018490	TTG	2	6	4751	4756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402574998
151	NC_018490	TCA	2	6	4758	4763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402574998
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153	NC_018490	CATA	2	8	4813	4820	50 %	25 %	0 %	25 %	402574998
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155	NC_018490	AATTA	2	10	4841	4850	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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157	NC_018490	TTC	2	6	4919	4924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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251	NC_018490	TTTA	2	8	8527	8534	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.